Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rin3P59729 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rin3P59729 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rin3P59729 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rin3P59729 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rin3P59729 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rin3P59729 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rin3P59729 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rin3P59729 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rin3P59729 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rin3P59729 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rin3P59729 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rin3P59729 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rin3P59729 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rin3P59729 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rin3P59729 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rin3P59729 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rin3P59729 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms