Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr8P58682 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr8P58682 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr8P58682 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr8P58682 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tlr8P58682 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr8P58682 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms