Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp1P58466 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms