Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rce1P57791 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rce1P57791 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rce1P57791 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rce1P57791 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rce1P57791 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rce1P57791 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rce1P57791 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rce1P57791 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms