Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samsn1P57725 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms