Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd38P56528 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd38P56528 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd38P56528 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd38P56528 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd38P56528 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd38P56528 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd38P56528 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd38P56528 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd38P56528 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd38P56528 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd38P56528 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd38P56528 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd38P56528 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd38P56528 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd38P56528 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd38P56528 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd38P56528 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms