Protein–RNA interactions for Protein: P56391

Cox6b1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6b1P56391 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6b1P56391 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox6b1P56391 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox6b1P56391 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6b1P56391 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6b1P56391 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6b1P56391 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6b1P56391 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox6b1P56391 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox6b1P56391 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6b1P56391 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cox6b1P56391 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox6b1P56391 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox6b1P56391 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox6b1P56391 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox6b1P56391 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox6b1P56391 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox6b1P56391 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox6b1P56391 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox6b1P56391 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms