Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad23bP54728 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad23bP54728 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms