Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa8P50706 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Defa8P50706 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Defa8P50706 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa8P50706 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa8P50706 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms