Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TspoP50637 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TspoP50637 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TspoP50637 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TspoP50637 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TspoP50637 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TspoP50637 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TspoP50637 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TspoP50637 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TspoP50637 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TspoP50637 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TspoP50637 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TspoP50637 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TspoP50637 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TspoP50637 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TspoP50637 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TspoP50637 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TspoP50637 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TspoP50637 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TspoP50637 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TspoP50637 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TspoP50637 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TspoP50637 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TspoP50637 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TspoP50637 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TspoP50637 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TspoP50637 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TspoP50637 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TspoP50637 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TspoP50637 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TspoP50637 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TspoP50637 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TspoP50637 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TspoP50637 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TspoP50637 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TspoP50637 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TspoP50637 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TspoP50637 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TspoP50637 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TspoP50637 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TspoP50637 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TspoP50637 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms