Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfbP49766 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfbP49766 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfbP49766 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfbP49766 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VegfbP49766 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfbP49766 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfbP49766 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfbP49766 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfbP49766 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.3 ms