Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rbp3P49194 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp3P49194 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms