Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LmnaP48678 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LmnaP48678 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LmnaP48678 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LmnaP48678 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LmnaP48678 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LmnaP48678 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LmnaP48678 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LmnaP48678 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LmnaP48678 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LmnaP48678 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms