Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms