Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms