Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc2P43407 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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