Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept1P42209 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept1P42209 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept1P42209 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sept1P42209 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sept1P42209 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept1P42209 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept1P42209 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept1P42209 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept1P42209 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sept1P42209 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept1P42209 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sept1P42209 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept1P42209 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms