Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col18a1P39061 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms