Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apoc3P33622 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms