Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx2P30658 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx2P30658 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms