Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gjb1P28230 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms