Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CenpbP27790 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CenpbP27790 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpbP27790 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpbP27790 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CenpbP27790 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CenpbP27790 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms