Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2afxP27661 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
H2afxP27661 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afxP27661 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afxP27661 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afxP27661 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afxP27661 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afxP27661 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afxP27661 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afxP27661 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afxP27661 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afxP27661 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afxP27661 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afxP27661 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afxP27661 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms