Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcb1aP21447 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcb1aP21447 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms