Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klra1P20937 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klra1P20937 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klra1P20937 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klra1P20937 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klra1P20937 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klra1P20937 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klra1P20937 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klra1P20937 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klra1P20937 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms