Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcer1aP20489 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms