Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms