Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgfb3P17125 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tgfb3P17125 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms