Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CnpP16330 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CnpP16330 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CnpP16330 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CnpP16330 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CnpP16330 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CnpP16330 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CnpP16330 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CnpP16330 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CnpP16330 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CnpP16330 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CnpP16330 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CnpP16330 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CnpP16330 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CnpP16330 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CnpP16330 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CnpP16330 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CnpP16330 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CnpP16330 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CnpP16330 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CnpP16330 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CnpP16330 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CnpP16330 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CnpP16330 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CnpP16330 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CnpP16330 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CnpP16330 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CnpP16330 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CnpP16330 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CnpP16330 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CnpP16330 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CnpP16330 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CnpP16330 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CnpP16330 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CnpP16330 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CnpP16330 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CnpP16330 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CnpP16330 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CnpP16330 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CnpP16330 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CnpP16330 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CnpP16330 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CnpP16330 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CnpP16330 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CnpP16330 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CnpP16330 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CnpP16330 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CnpP16330 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CnpP16330 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CnpP16330 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CnpP16330 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CnpP16330 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CnpP16330 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CnpP16330 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CnpP16330 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CnpP16330 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CnpP16330 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CnpP16330 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CnpP16330 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CnpP16330 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms