Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhbP16125 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdhbP16125 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdhbP16125 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LdhbP16125 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LdhbP16125 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LdhbP16125 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdhbP16125 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdhbP16125 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdhbP16125 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LdhbP16125 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdhbP16125 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms