Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt8P11679 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt8P11679 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt8P11679 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt8P11679 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt8P11679 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt8P11679 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms