Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DmdP11531 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DmdP11531 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DmdP11531 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DmdP11531 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DmdP11531 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DmdP11531 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DmdP11531 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DmdP11531 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DmdP11531 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DmdP11531 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DmdP11531 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DmdP11531 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DmdP11531 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DmdP11531 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DmdP11531 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DmdP11531 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DmdP11531 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DmdP11531 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DmdP11531 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DmdP11531 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DmdP11531 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DmdP11531 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DmdP11531 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DmdP11531 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DmdP11531 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DmdP11531 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DmdP11531 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DmdP11531 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DmdP11531 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DmdP11531 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DmdP11531 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DmdP11531 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DmdP11531 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DmdP11531 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DmdP11531 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DmdP11531 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DmdP11531 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DmdP11531 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DmdP11531 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DmdP11531 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DmdP11531 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DmdP11531 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DmdP11531 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DmdP11531 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DmdP11531 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DmdP11531 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DmdP11531 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DmdP11531 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DmdP11531 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DmdP11531 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DmdP11531 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DmdP11531 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DmdP11531 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DmdP11531 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DmdP11531 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DmdP11531 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DmdP11531 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DmdP11531 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DmdP11531 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DmdP11531 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DmdP11531 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DmdP11531 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DmdP11531 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DmdP11531 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DmdP11531 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DmdP11531 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DmdP11531 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DmdP11531 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DmdP11531 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DmdP11531 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DmdP11531 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DmdP11531 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DmdP11531 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DmdP11531 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DmdP11531 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DmdP11531 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DmdP11531 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DmdP11531 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DmdP11531 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DmdP11531 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DmdP11531 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DmdP11531 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DmdP11531 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms