Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fv4P11370 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fv4P11370 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fv4P11370 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fv4P11370 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fv4P11370 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fv4P11370 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fv4P11370 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fv4P11370 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fv4P11370 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fv4P11370 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fv4P11370 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fv4P11370 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms