Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnmt3cP0DOY1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnmt3cP0DOY1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms