Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Amd1P0DMN7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms