Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb5P09079 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms