Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms