Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NeflP08551 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NeflP08551 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NeflP08551 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NeflP08551 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NeflP08551 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NeflP08551 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NeflP08551 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NeflP08551 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NeflP08551 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NeflP08551 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NeflP08551 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NeflP08551 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NeflP08551 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NeflP08551 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NeflP08551 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NeflP08551 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NeflP08551 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NeflP08551 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NeflP08551 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NeflP08551 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NeflP08551 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NeflP08551 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NeflP08551 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NeflP08551 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NeflP08551 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NeflP08551 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NeflP08551 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NeflP08551 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NeflP08551 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NeflP08551 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NeflP08551 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NeflP08551 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NeflP08551 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NeflP08551 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NeflP08551 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NeflP08551 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NeflP08551 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NeflP08551 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NeflP08551 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NeflP08551 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NeflP08551 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NeflP08551 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NeflP08551 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NeflP08551 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NeflP08551 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NeflP08551 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NeflP08551 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NeflP08551 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NeflP08551 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NeflP08551 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NeflP08551 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NeflP08551 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NeflP08551 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NeflP08551 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NeflP08551 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NeflP08551 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NeflP08551 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NeflP08551 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NeflP08551 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NeflP08551 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NeflP08551 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NeflP08551 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NeflP08551 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NeflP08551 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NeflP08551 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NeflP08551 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NeflP08551 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NeflP08551 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NeflP08551 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NeflP08551 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NeflP08551 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NeflP08551 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NeflP08551 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NeflP08551 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NeflP08551 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NeflP08551 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NeflP08551 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NeflP08551 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NeflP08551 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NeflP08551 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NeflP08551 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NeflP08551 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NeflP08551 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NeflP08551 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NeflP08551 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NeflP08551 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NeflP08551 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NeflP08551 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NeflP08551 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NeflP08551 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NeflP08551 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NeflP08551 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NeflP08551 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NeflP08551 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NeflP08551 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NeflP08551 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NeflP08551 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NeflP08551 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NeflP08551 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms