Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spta1P08032 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spta1P08032 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spta1P08032 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spta1P08032 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spta1P08032 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spta1P08032 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spta1P08032 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spta1P08032 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms