Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms