Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06335 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06335 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06335 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06335 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06335 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06335 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06335 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06335 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06335 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06335 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06335 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06335 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06335 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06335 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06335 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06335 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06335 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06335 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06335 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06335 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06335 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06335 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06335 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06335 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06335 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06335 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06335 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06335 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06335 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06335 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06335 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06335 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06335 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06335 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06335 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06335 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06335 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06335 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06335 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P06335 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms