Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06323 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06323 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06323 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06323 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06323 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06323 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06323 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06323 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06323 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06323 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06323 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06323 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06323 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06323 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06323 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06323 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06323 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06323 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06323 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06323 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06323 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06323 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06323 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06323 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P06323 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06323 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06323 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06323 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06323 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06323 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06323 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06323 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06323 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06323 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06323 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06323 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06323 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06323 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06323 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06323 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06323 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06323 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06323 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06323 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06323 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06323 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06323 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06323 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06323 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06323 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06323 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06323 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06323 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06323 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06323 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06323 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06323 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06323 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06323 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06323 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06323 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06323 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06323 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06323 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06323 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06323 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06323 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06323 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06323 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06323 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06323 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06323 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06323 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06323 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06323 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06323 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06323 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06323 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P06323 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P06323 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P06323 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06323 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06323 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06323 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06323 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms