Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa7P02830 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa7P02830 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms