Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01788 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01788 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01788 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01788 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01788 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01788 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01788 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01788 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01788 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01788 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01788 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01788 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01788 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01788 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01788 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01788 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01788 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01788 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01788 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01788 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01788 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01788 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01788 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01788 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01788 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01788 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01788 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01788 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01788 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01788 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01788 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms