Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01658 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01658 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01658 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01658 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01658 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01658 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01658 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01658 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01658 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01658 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01658 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01658 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01658 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01658 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01658 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01658 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01658 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01658 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01658 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01658 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01658 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01658 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01658 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01658 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01658 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms