Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms