Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTCP00480 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTCP00480 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTCP00480 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
OTCP00480 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTCP00480 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTCP00480 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTCP00480 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTCP00480 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTCP00480 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTCP00480 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTCP00480 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTCP00480 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTCP00480 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OTCP00480 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
OTCP00480 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTCP00480 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTCP00480 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTCP00480 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTCP00480 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTCP00480 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTCP00480 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTCP00480 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTCP00480 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTCP00480 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTCP00480 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTCP00480 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTCP00480 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTCP00480 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTCP00480 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTCP00480 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTCP00480 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTCP00480 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTCP00480 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTCP00480 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTCP00480 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTCP00480 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTCP00480 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTCP00480 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTCP00480 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTCP00480 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms