Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcnkO88874 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcnkO88874 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcnkO88874 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms