Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JtbO88824 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JtbO88824 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
JtbO88824 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
JtbO88824 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JtbO88824 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JtbO88824 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JtbO88824 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JtbO88824 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JtbO88824 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JtbO88824 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JtbO88824 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JtbO88824 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JtbO88824 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JtbO88824 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JtbO88824 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JtbO88824 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JtbO88824 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JtbO88824 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JtbO88824 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JtbO88824 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JtbO88824 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JtbO88824 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JtbO88824 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JtbO88824 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JtbO88824 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JtbO88824 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JtbO88824 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JtbO88824 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JtbO88824 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JtbO88824 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JtbO88824 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JtbO88824 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JtbO88824 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JtbO88824 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JtbO88824 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JtbO88824 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
JtbO88824 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms