Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tom1O88746 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tom1O88746 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tom1O88746 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tom1O88746 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tom1O88746 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tom1O88746 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tom1O88746 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tom1O88746 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tom1O88746 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tom1O88746 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tom1O88746 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms